Traditionnellement, le son du tonnerre dans les nombreuses montagnes et vallées du Bhoutan est censé être la voix des dragons, et le pays est connu comme le «pays du dragon du tonnerre» dans sa langue maternelle. Cependant, la conception du dragon du drapeau peut avoir été influencée par des conceptions similaires utilisées pendant des siècles par les voisins chinois. Dans ses griffes, le dragon sur le drapeau saisit des bijoux, représentant la richesse nationale et la perfection. Le dragon, qui était à l'origine vert, est maintenant blanc, symbolisant la pureté et la loyauté de divers groupes ethniques dans le pays. La couleur jaune-orange, que le gouvernement bhoutanais qualifie officiellement de jaune, symbolise le pouvoir du roi, en tant que chef du gouvernement laïque, tandis que le rouge-orange est associé au Bka'-brgyud-pa (Kagyupa) et Rnying-ma-pa (Nyingmapa) Les sectes bouddhistes et avec l'engagement religieux de la nation.
La date exacte d'introduction de ce drapeau est inconnue, mais elle pourrait avoir eu lieu en 1971, lorsque le Bhoutan a rejoint les Nations Unies. Jusqu'aux années 1960, le Bhoutan était en grande partie fermé au monde extérieur; ses relations extérieures ont été conduites par le Royaume-Uni (1910-1949) et par l'Inde (de 1949 aux années 1960). L'isolement du Bhoutan et l'absence de littoral limitaient strictement les circonstances dans lesquelles un drapeau national était requis.
