Conformation, l'un quelconque du nombre infini d'arrangements spatiaux possibles d'atomes dans une molécule qui résultent de la rotation de ses groupes constitutifs d'atomes autour de liaisons simples.
protéine: Conformation des protéines dans les interfaces
Comme de nombreuses autres substances à la fois hydrophiles et hydrophobes, les protéines solubles ont tendance à migrer à l'interface entre l'air
Différentes conformations sont possibles pour toute molécule dans laquelle une seule liaison covalente relie deux groupes polyatomiques, dans chacun desquels au moins un atome ne se situe pas le long de l'axe de la simple liaison en question. La molécule la plus simple est celle du peroxyde d'hydrogène, dans laquelle les deux groupes hydroxyle peuvent tourner l'un par rapport à l'autre autour de l'axe de la liaison oxygène-oxygène. La présence de plus d'une liaison unique dans une molécule - comme dans celle du propane (CH 3 ― CH 2 ― CH 3), par exemple - ne fait qu'ajouter à la complexité de la situation sans en changer la nature. Dans des molécules telles que celles de cyanogène (N≡C ― C≡N) ou de butadiyne (H ― C≡C ― C≡C ― H), tous les atomes se trouvent le long de l'axe de la liaison simple centrale, de sorte qu'aucune conformation distincte exister.
En général, chaque conformation distincte d'une molécule représente un état d'énergie potentielle différente en raison du fonctionnement de forces attractives ou répulsives qui varient avec les distances entre les différentes parties de la structure. Si ces forces étaient absentes, toutes les conformations auraient la même énergie et la rotation autour de la liaison unique serait complètement libre ou sans restriction. Si les forces sont fortes, différentes conformations diffèrent considérablement en énergie ou en stabilité: la molécule occupera normalement un état stable (un de faible énergie) et ne subira une transition vers un autre état stable qu'en absorbant suffisamment d'énergie pour atteindre et traverser l'instable intervenant conformation.
Les forces intramoléculaires dans l'éthane, par exemple, sont si faibles que leur existence ne peut être déduite que d'effets subtils sur les propriétés thermodynamiques telles que l'enthalpie et l'entropie. (Même si la rotation interne dans l'éthane était sévèrement restreinte, ses trois conformations les plus stables sont indiscernables.) Les structures moléculaires de certains composés plus complexes, cependant, imposent des barrières à la rotation si fortes que les formes stéréoisomères - ne différant que par la conformation - sont suffisamment stables pour être isolé.
