La biogéochimie, l'étude du comportement des éléments chimiques inorganiques dans les systèmes biologiques de portée géologique par opposition à la géochimie organique, qui est l'étude des composés organiques trouvés dans les matériaux géologiques et les météorites, y compris ceux d'origine biologique problématique. Les sujets classés en biogéochimie et en géochimie organique comprennent l'origine du pétrole, l'origine de la vie, la composition des atmosphères primitives, la prospection biogéochimique des gisements minéraux, l'origine de certains gisements de minerai, la chimie des eaux naturelles, la formation des sols et la chimie de charbon. Presque tous les processus géologiques qui se produisent à la surface de la Terre sont affectés par l'activité biologique.
