Roderick MacKinnon, (né le 19 février 1956, Burlington, Massachusetts, États-Unis), médecin américain, corecipient du prix Nobel de chimie en 2003 pour ses recherches pionnières sur les canaux ioniques dans les membranes cellulaires. Il a partagé le prix avec Peter Agre, également des États-Unis.
MacKinnon a obtenu un doctorat en médecine à l'École de médecine de l'Université Tufts en 1982. Après avoir pratiqué la médecine pendant plusieurs années, il s'est tourné vers la recherche fondamentale, en commençant en 1986 par un travail postdoctoral sur les canaux ioniques à l'Université Brandeis. En 1989, il a rejoint l'Université Harvard et en 1996, il a rejoint l'Université Rockefeller en tant que professeur et chef de laboratoire. Un an plus tard, il a été nommé enquêteur au Howard Hughes Medical Institute de Rockefeller.
D'une importance particulière pour le système nerveux et le cœur, les canaux ioniques sont des ouvertures spécialisées dans les membranes cellulaires qui permettent aux ions, tels que le potassium et le sodium, de pénétrer et d'entrer facilement dans les cellules; des structures similaires existent également pour le passage de l'eau. Le travail révolutionnaire de MacKinnon s'est concentré sur les «filtres» dans les canaux qui passaient un type d'ion tout en bloquant les autres. Pour comprendre le fonctionnement de ces filtres, il a obtenu des images plus nettes des canaux en utilisant la diffraction des rayons X. En 1998, il a déterminé la structure moléculaire tridimensionnelle d'un canal ionique. Le canal, a découvert MacKinnon, a une architecture dimensionnée de manière à éliminer facilement les ions potassium - mais pas les ions sodium - de leurs molécules d'eau associées et leur permet de passer à travers. Il a également trouvé un «capteur» moléculaire à l'extrémité du canal le plus proche de l'intérieur de la cellule qui réagit aux conditions autour de la cellule, envoyant des signaux qui ouvrent et ferment le canal aux moments appropriés. Son travail de pionnier a permis aux scientifiques de poursuivre le développement de médicaments pour les maladies dans lesquelles les canaux ioniques jouent un rôle.
