Dans le cadre du système de tutelle des Nations Unies mis en place après la Seconde Guerre mondiale, les Français avaient l'obligation de faire passer le Togo vers l'autonomie. Un drapeau local a été adopté en 1956, peu de temps avant que le pays ne devienne une république autonome au sein de l'Union française. Le fond vert du drapeau représentait l'agriculture, l'espoir et la jeunesse; le tricolore français dans le coin supérieur du treuil était un rappel de la domination française. Deux étoiles jaunes à cinq branches, disposées sur une diagonale imaginaire allant du treuil inférieur à la mouche supérieure, faisaient référence aux plaines côtières du sud et aux savanes du nord, «unies par amour de l'ordre et du travail».
Le 27 avril 1960, le Togo est devenu indépendant sous un tout nouveau drapeau; il a réduit les deux étoiles à une afin de souligner l'unité nationale. Les cinq bandes vertes et jaunes du drapeau correspondent aux régions administratives du pays, tandis que ces couleurs rappellent que l'écrasante majorité de la population dépend de la terre pour sa subsistance (vert) et de son propre travail pour le développement (jaune). Le canton rouge représenterait l'amour, la fidélité et la charité, tandis que l'étoile blanche est associée à la pureté. Les mêmes couleurs panafricaines rouge-jaune-vert ont été sélectionnées par plusieurs autres pays qui ont obtenu leur indépendance peu de temps avant ou après le Togo.
