Alternance de générations, également appelée métagénèse ou hétérogénèse, en biologie, alternance d'une phase sexuelle et d'une phase asexuée dans le cycle de vie d'un organisme. Les deux phases, ou générations, sont souvent morphologiquement et parfois chromosomiquement distinctes.
Chez les algues, les champignons et les plantes, l'alternance des générations est courante. Il n'est cependant pas toujours facile à observer, car l'une ou l'autre des générations est souvent très petite, voire microscopique. La phase sexuelle, appelée génération de gamétophytes, produit des gamètes ou cellules sexuelles, et la phase asexuée, ou génération de sporophytes, produit des spores de manière asexuée. En termes de chromosomes, le gamétophyte est haploïde (a un seul ensemble de chromosomes), et le sporophyte est diploïde (a un double ensemble). Chez les bryophytes, comme les mousses et les hépatiques, le gamétophyte est la phase de vie dominante, tandis que chez les angiospermes et les gymnospermes, le sporophyte est dominant. La phase haploïde est également dominante chez les champignons. Bien que certaines algues aient des stades de cycle de vie déterminés, de nombreuses espèces alternent entre les phases sexuelle et asexuée en réponse aux conditions environnementales.
Chez les animaux, de nombreux invertébrés ont une alternance de générations sexuelles et asexuées (par exemple, protozoaires, méduses, vers plats), mais l'alternance des générations haploïdes et diploïdes est inconnue.
